АНАЛИЗ МЕЖСОРТОВОГО ПОЛИМОРФИЗМА ЛЮПИНА ЖЕЛТОГО (LUPINUS LUTEUS L.) С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ EST-SSR И SRAP-RGA МАРКЕРОВ
https://doi.org/10.29235/1029-8940-2018-63-3-298-306
Аннотация
Показана эффективность применения EST-SSR маркеров для дифференциации образцов люпина желтого. Отобраны EST-SSR маркеры с высокими и умеренными значениями PIC (0,64–0,49) – 2itg50945, 2itg03938, 2itg20349, 2itg14694, 2itg26293, 2itg45631, пригодные для выявления генетического полиморфизма. Установлены достоверные корреляции фрагментов EST-SSR профилей с отдельными признаками продуктивности в расщепляющихся гибридных популяциях F2 от межсортовых скрещиваний люпина желтого.
Об авторах
Е. Н. Сысолятин
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси, Минск
Беларусь
мл. науч. сотрудник
Беларусь
мл. науч. сотрудник
Н. В. Анисимова
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси, Минск
Беларусь
канд. биол. наук, ст. науч. сотрудник
Беларусь
канд. биол. наук, ст. науч. сотрудник
О. Г. Бабак
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси, Минск
Беларусь
канд. биол. наук, доцент, вед. науч. сотрудник
Беларусь
канд. биол. наук, доцент, вед. науч. сотрудник
В. С. Анохина
Белорусский государственный университет, Минск
Беларусь
канд. биол. наук, доцент
Беларусь
канд. биол. наук, доцент
И. Ю. Романчук
Белорусский государственный университет, Минск
Беларусь
науч. сотрудник
Беларусь
науч. сотрудник
А. В. Кильчевский
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси, Минск
Беларусь
академик, д-р биол. наук, профессор, заведующий лабораторией
Беларусь
академик, д-р биол. наук, профессор, заведующий лабораторией
Список литературы
1. Привалов, Ф. И. Перспективы возделывания, селекции и семеноводства люпина в Беларуси / Ф. И. Привалов, В. Ч. Шор // Вес. Нац. Акад. навук Беларусi. Сер. аграр. навук. – 2015. – № 2. – С. 47–53.
2. Development of microsatellite markers in Lupinus luteus (Fabaceae) and cross-species amplification in other lupine species / L. B. P. Gonzalez [et al.] // Amer. J. of Botany. – 2010. – Vol. 97, N 8. – P. e72–e74. https://doi.org/10.3732/ajb.1000170
3. Use of EST-SSR markers for evaluating genetic diversity and fingerprinting Celery (Apium graveolens L.) cultivars / N. Fu [et al.] // Molecules. – 2014. – Vol. 19, N 2. – Р. 1939–1955. https://doi.org/10.3390/molecules19021939
4. Assessment of genetic diversity in the sorghum reference set using EST-SSR markers / P. Ramu [et al.] // Theoretical and Appl. Genetics. – 2013. – Vol. 126, N 8. – P. 2051–2064. https://doi.org/10.1007/s00122-013-2117-6
5. Determination of the genetic diversity of vegetable soybean [Glycine max (L.) Merr.] using EST-SSR markers / G. Zhang [et al.] // J. of Zhejiang University. SCIENCE B. Biomedicine and Biotechnology. – 2013. – Vol. 14, N 4. – P. 279– 288. https://doi.org/10.1631/jzus.B1200243
6. Development and characterization of genomic and expressed SSRs for levant cotton (Gossypium herbaceum L.) / S. N. Jena [et al.] // Theoretical and Appl. Genetics. – 2012. – Vol. 124, N 3. – P. 565–576. https://doi.org/10.1007/s00122-011-1729-y
7. Hu, J. Comparison of genomic SSR and EST-SSR markers for estimating genetic diversity in cucumber / J. Hu, L. Wang, J. Li // Biologia Plantarum. – 2011. – Vol. 55, N 3. – P. 577–580. https://doi.org/10.1007/s10535-011-0129-0
8. Identification and development of polymorphic EST-SSR markers by sequence alignment in pepper Capsicum annuum (Solanaceae) / Q. Kong [et al.] // Amer. J. of Botany. – 2012. – Vol. 99, N 2. – P. e59–e 61. https://doi.org/10.3732/ajb.1100347
9. Development of EST-SSR and genomic-SSR markers to assess genetic diversity in Jatropha curcas L. / M. Wen [et al.] // BMC Res. Notes. – 2010. – Vol. 42, N 3. – 8 p. https://doi.org/10.1186/1756-0500-3-42
10. Yellow lupin (Lupinus luteus L.) transcriptome sequencing: molecular marker development and comparative studies / L. B. Parra-González [et al.] // BMC Genomics. – 2012. – Vol. 13, N 1. – P. 425. https://doi.org/10.1186/1471-2164-13-425
11. The Ncm-1 gene for resistance to Cucumber mosaic virus in yellow lupin (Lupinus luteus): molecular studies and marker development : Ph. D. Thesis / D. Li ; Murdoch Univ. – Perth, 2012. – 201 p.
12. A PCR-based molecular marker applicable for marker-assisted selection for anthracnose disease resistance in lupin breeding / M. You [et al.] // Cellular and Molecular Biology Lett. – 2005. – Vol. 10, N 1. – P. 123–134.
13. Li, G. Sequence-related amplifed polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica / G. Li, C. F. Quiros // Theoretical and Appl. Genetics. – 2001. – Vol. 103, N 2–3. – P. 455–461. https://doi.org/10.1007/s001220100570
14. Development of SRAP, SRAP-RGA, RAPD and SCAR markers linked with a Fusarium wilt resistance gene in eggplant / N. Mutlu [et al.] // Theoretical and Appl. Genetics. – 2008. – Vol. 117, N 8. – P. 1303–1312. https://doi.org/10.1007/ s00122-008-0864-6
15. Оценка эффективности метода SRAP-RGA ПЦР для генотипирования узколистного люпина / Е. Н. Сысолятин [и др.] // Молекулярная и прикладная генетика : сб. науч. тр. / Ин-т генетики и цитологии НАН Беларуси. – Минск, 2016. – Т. 21. – С. 46–52.
16. Ma, J. X. Genetic diversity of wild Medicago sativa by sequence-related amplified polymorphism markers in Xingjiang region, China / J. X. Ma, X. S. Lu, T. M. Wang // Pakistan J. of Botany. – 2013. – Vol. 45, N 6. – P. 2043–2050.
17. Чесноков, Ю. В. Оценка меры информационного полиморфизма генетического разнообразия / Ю. В. Чесноков, А. М. Артемьева // Сельскохозяйств. биология. – 2015. – Т. 50, № 5. – С. 571–578.
18. Молекулярные методы паспортизации сортов груши / О. Ю. Урбанович [и др.] // Молекулярная и прикладная генетика : сб. науч. тр. / Ин-т генетики и цитологии НАН Беларуси. – Минск, 2009. – Т. 9. – С. 160–166.
19. AFLP markers reveal high polymorphic rates in ryegrasses (Lolium spp.) / I. Roldàn-Ruiz [et al.] // Molecular Breeding. – 2000. – Vol. 6, N 2. – P. 125–134. https://doi.org/10.1023/A:1009680614564
20. Seyit, A. K. Comparison of effectiveness of ISSR and RAPD markers in genetic characterization of seized marijuana (Cannabis sativa L.) in Turkey / A. K. Seyit, E. H. Erdogan, P. Emine // Afr. J. of Agr. Res. – 2012. – Vol. 5, N 21. – P. 2925–2933.
21. Perrier, X. DARwin software [Electronic resourse] / X. Perrier, J. P. Jacquemoud-Collet. – 2006. – Mode of access : http://darwin.cirad.fr/. – Date of access : 15.07.2015.
22. Hildebrand, C. E. Informativeness of polymorphic DNA markers / C. E. Hildebrand, D. C. Torney, R. P. Wagner // Los Alamos Science. – 1992. – N 20. – P. 100–102.
Рецензия
Просмотров: 600
Послать статью по эл. почте 
