Preview

Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия биологических наук

Пашыраны пошук

АНАЛИЗ МЕЖСОРТОВОГО ПОЛИМОРФИЗМА ЛЮПИНА ЖЕЛТОГО (LUPINUS LUTEUS L.) С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ EST-SSR И SRAP-RGA МАРКЕРОВ

https://doi.org/10.29235/1029-8940-2018-63-3-298-306

Анатацыя

Показана эффективность применения EST-SSR маркеров для дифференциации образцов люпина желтого. Отобраны EST-SSR маркеры с высокими и умеренными значениями PIC (0,64–0,49) – 2itg50945, 2itg03938, 2itg20349, 2itg14694, 2itg26293, 2itg45631, пригодные для выявления генетического полиморфизма. Установлены достоверные корреляции фрагментов EST-SSR профилей с отдельными признаками продуктивности в расщепляющихся гибридных популяциях F2 от межсортовых скрещиваний люпина желтого.

Аб аўтарах

Е. Сысолятин
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси, Минск
Беларусь


Н. Анисимова
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси, Минск
Беларусь


О. Бабак
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси, Минск
Беларусь


В. Анохина
Белорусский государственный университет, Минск
Беларусь


И. Романчук
Белорусский государственный университет, Минск
Беларусь


А. Кильчевский
Институт генетики и цитологии НАН Беларуси, Минск
Беларусь


Спіс літаратуры

1. Привалов, Ф. И. Перспективы возделывания, селекции и семеноводства люпина в Беларуси / Ф. И. Привалов, В. Ч. Шор // Вес. Нац. Акад. навук Беларусi. Сер. аграр. навук. – 2015. – № 2. – С. 47–53.

2. Development of microsatellite markers in Lupinus luteus (Fabaceae) and cross-species amplification in other lupine species / L. B. P. Gonzalez [et al.] // Amer. J. of Botany. – 2010. – Vol. 97, N 8. – P. e72–e74. https://doi.org/10.3732/ajb.1000170

3. Use of EST-SSR markers for evaluating genetic diversity and fingerprinting Celery (Apium graveolens L.) cultivars / N. Fu [et al.] // Molecules. – 2014. – Vol. 19, N 2. – Р. 1939–1955. https://doi.org/10.3390/molecules19021939

4. Assessment of genetic diversity in the sorghum reference set using EST-SSR markers / P. Ramu [et al.] // Theoretical and Appl. Genetics. – 2013. – Vol. 126, N 8. – P. 2051–2064. https://doi.org/10.1007/s00122-013-2117-6

5. Determination of the genetic diversity of vegetable soybean [Glycine max (L.) Merr.] using EST-SSR markers / G. Zhang [et al.] // J. of Zhejiang University. SCIENCE B. Biomedicine and Biotechnology. – 2013. – Vol. 14, N 4. – P. 279– 288. https://doi.org/10.1631/jzus.B1200243

6. Development and characterization of genomic and expressed SSRs for levant cotton (Gossypium herbaceum L.) / S. N. Jena [et al.] // Theoretical and Appl. Genetics. – 2012. – Vol. 124, N 3. – P. 565–576. https://doi.org/10.1007/s00122-011-1729-y

7. Hu, J. Comparison of genomic SSR and EST-SSR markers for estimating genetic diversity in cucumber / J. Hu, L. Wang, J. Li // Biologia Plantarum. – 2011. – Vol. 55, N 3. – P. 577–580. https://doi.org/10.1007/s10535-011-0129-0

8. Identification and development of polymorphic EST-SSR markers by sequence alignment in pepper Capsicum annuum (Solanaceae) / Q. Kong [et al.] // Amer. J. of Botany. – 2012. – Vol. 99, N 2. – P. e59–e 61. https://doi.org/10.3732/ajb.1100347

9. Development of EST-SSR and genomic-SSR markers to assess genetic diversity in Jatropha curcas L. / M. Wen [et al.] // BMC Res. Notes. – 2010. – Vol. 42, N 3. – 8 p. https://doi.org/10.1186/1756-0500-3-42

10. Yellow lupin (Lupinus luteus L.) transcriptome sequencing: molecular marker development and comparative studies / L. B. Parra-González [et al.] // BMC Genomics. – 2012. – Vol. 13, N 1. – P. 425. https://doi.org/10.1186/1471-2164-13-425

11. The Ncm-1 gene for resistance to Cucumber mosaic virus in yellow lupin (Lupinus luteus): molecular studies and marker development : Ph. D. Thesis / D. Li ; Murdoch Univ. – Perth, 2012. – 201 p.

12. A PCR-based molecular marker applicable for marker-assisted selection for anthracnose disease resistance in lupin breeding / M. You [et al.] // Cellular and Molecular Biology Lett. – 2005. – Vol. 10, N 1. – P. 123–134.

13. Li, G. Sequence-related amplifed polymorphism (SRAP), a new marker system based on a simple PCR reaction: its application to mapping and gene tagging in Brassica / G. Li, C. F. Quiros // Theoretical and Appl. Genetics. – 2001. – Vol. 103, N 2–3. – P. 455–461. https://doi.org/10.1007/s001220100570

14. Development of SRAP, SRAP-RGA, RAPD and SCAR markers linked with a Fusarium wilt resistance gene in eggplant / N. Mutlu [et al.] // Theoretical and Appl. Genetics. – 2008. – Vol. 117, N 8. – P. 1303–1312. https://doi.org/10.1007/ s00122-008-0864-6

15. Оценка эффективности метода SRAP-RGA ПЦР для генотипирования узколистного люпина / Е. Н. Сысолятин [и др.] // Молекулярная и прикладная генетика : сб. науч. тр. / Ин-т генетики и цитологии НАН Беларуси. – Минск, 2016. – Т. 21. – С. 46–52.

16. Ma, J. X. Genetic diversity of wild Medicago sativa by sequence-related amplified polymorphism markers in Xingjiang region, China / J. X. Ma, X. S. Lu, T. M. Wang // Pakistan J. of Botany. – 2013. – Vol. 45, N 6. – P. 2043–2050.

17. Чесноков, Ю. В. Оценка меры информационного полиморфизма генетического разнообразия / Ю. В. Чесноков, А. М. Артемьева // Сельскохозяйств. биология. – 2015. – Т. 50, № 5. – С. 571–578.

18. Молекулярные методы паспортизации сортов груши / О. Ю. Урбанович [и др.] // Молекулярная и прикладная генетика : сб. науч. тр. / Ин-т генетики и цитологии НАН Беларуси. – Минск, 2009. – Т. 9. – С. 160–166.

19. AFLP markers reveal high polymorphic rates in ryegrasses (Lolium spp.) / I. Roldàn-Ruiz [et al.] // Molecular Breeding. – 2000. – Vol. 6, N 2. – P. 125–134. https://doi.org/10.1023/A:1009680614564

20. Seyit, A. K. Comparison of effectiveness of ISSR and RAPD markers in genetic characterization of seized marijuana (Cannabis sativa L.) in Turkey / A. K. Seyit, E. H. Erdogan, P. Emine // Afr. J. of Agr. Res. – 2012. – Vol. 5, N 21. – P. 2925–2933.

21. Perrier, X. DARwin software [Electronic resourse] / X. Perrier, J. P. Jacquemoud-Collet. – 2006. – Mode of access : http://darwin.cirad.fr/. – Date of access : 15.07.2015.

22. Hildebrand, C. E. Informativeness of polymorphic DNA markers / C. E. Hildebrand, D. C. Torney, R. P. Wagner // Los Alamos Science. – 1992. – N 20. – P. 100–102.


##reviewer.review.form##

Праглядаў: 601


Creative Commons License
Кантэнт даступны пад ліцэнзіяй Creative Commons Attribution 3.0 License.


ISSN 1029-8940 (Print)
ISSN 2524-230X (Online)