Определение вирусной нагрузки TTV в биологическом материале целевых групп пациентов с использованием молекулярно-генетического метода

В результате проведенных исследований выбрана мишень генома Torque Teno Virus (TTV), разработан набор праймеров и TaqMan-зонда, фланкирующих консервативный регион длиной 111 п. н. (позиции нуклеотидов 103–213 референсного генома TTV TA278 GenBank: AB017610.1), ставший основой молекулярно-генетического метода диагностики TTV-инфекции, позволяющего выявлять и рассчитывать вирусную нагрузку TTV в биологическом материале человека. С помощью разработанного молекулярно-генетического метода обнаружена высокая частота выявления ДНК TTV в плазме (71,4–90,4 %) и в лейкоцитарной фракции крови (81,0–97,1 %) как в контрольной группе, так и у пациентов со вторичным иммунодефицитом, с ВИЧ-инфекцией и тяжелым течением инфекции COVID-19. Определена вирусная нагрузка TTV в целевых группах. Выявлена значимо более низкая медиана вирусной нагрузки TTV в лейкоцитарной фракции крови контрольной группы – 2,58 [1,66; 3,25] log₁₀ копий ДНК TTV/10⁵ клеток, чем в группе пациентов со вторичным иммунодефицитом – 3,67 [1,88; 4,47] log₁₀ копий ДНК TTV/10⁵ клеток (р = 0,0014), пациентов с ВИЧ-инфекцией – 3,84 [3,09; 4,20] log₁₀ копий ДНК TTV/10⁵ клеток (р < 0,001) и в группе пациентов с тяжелым течением инфекции COVID-19, точка 1 – 3,67 [3,09; 3,91] log₁₀ копий ДНК TTV/10⁵ клеток (р < 0,001).

1. Virus Taxonomy: 2024 Release // International Committee on Taxonomy of Viruses. – URL: https://ictv.global/taxonomy (date of access: 10.02.2026).

2. Anelloviridae taxonomy update 2023 / A. Varsani, S. Kraberger, T. Opriessnig [et al.] // Archives of Virology. – 2023. – Vol. 168. – Art. 277. https://doi.org/10.1007/s00705-023-05903-6

3. Differentiating between viruses and virus species by writing their names correctly / F. M. Zerbini, S. G. Siddell, A. R. Mu - shegian [et al.] // Archives of Virology. – 2022. – Vol. 167, N 4. – P. 1231–1234. https://doi.org/10.1007/s00705-021-05323-4

4. A Novel DNA Virus (TTV) Associated with Elevated Transaminase Levels in Posttransfusion Hepatitis of Unknown Etiology / T. Nishizawa, H. Okamoto, K. Konishib [et al.] // Biochemical and Biophysical Research Communications. – 1997. – Vol. 241, N 1. – P. 92–97. https://doi.org/10.1006/bbrc.1997.7765

5. Laubscher, F. SCANellome V2: Update of the Primate Anellovirus Reference Sequences Database / F. Laubscher, L. Kaiser, S. Cordey // Viruses. – 2024. – Vol. 16, N 9. – Art. 1349. https://doi.org/10.3390/v16091349

6. Taxonomic update for mammalian anelloviruses (family Anelloviridae) / A. Varsani, T. Opriessnig, V. Celer [et al.] // Archives of Virology. – 2021. – Vol. 166, N 10. – P. 2943–2953. https://doi.org/10.1007/s00705-021-05192-x

7. Torque Teno Virus: Lights and Shades / P. Brani, H. Z. Manzoor, P. G. Spezia [et al.] // Viruses. – 2025. – Vol. 17, N 3. – Art. 334. https://doi.org/10.3390/v17030334

8. Prevalence of Torque Teno Virus in Portuguese Children Younger Than 3 Years Old: A Single-Center Study / M.-J. Chasqueira, P. Paixão, C. Barreiros [et al.] // Clinical Pediatrics. – 2025. – Vol. 64, N 10. – P. 1419–1424. https://doi.org/10.1177/00099228251339047

9. Development of PCR Assays with Nested Primers Specific for Differential Detection of Three Human Anelloviruses and Early Acquisition of Dual or Triple Infection during Infancy / M. Ninomiya, M. Takahashi, T. Nishizawa [et al.] // Journal of Clinical Microbiology. – 2008. – Vol. 46, N 2. – P. 507–514. https://doi.org/10.1128/jcm.01703-07

10. The enigmatic roles of Anelloviridae and Redondoviridae in humans / L. Taylor, E. Keeler, F. Bushman, R. Collman // Current Opinion in Virology. – 2022. – Vol. 55. – Art. 101248. https://doi.org/10.1016/j.coviro.2022.101248

11. TT virus prevalence, viral loads and genotypic variability in saliva from healthy Japanese children / M. Naganuma, N. Tominaga, T. Miyamura [et al.] // Acta Paediatrica. – 2008. – Vol. 97, N 12. – P. 1686–1690. https://doi.org/10.1111/j.16512227.2008.00962.x

12. Deep viral blood metagenomics reveals extensive anellovirus diversity in healthy humans / M. Cebriá-Mendoza, C. Arbona, L. Larrea [et al.] // Scientific Reports. – 2021. – Vol. 11, N 1. – Art. 6921. https://doi.org/10.1038/s41598-021-86427-4

13. Systematic review and meta-analysis of virome profiles and quantification of Torque teno virus load in blood of acute febrile illness patients / C. Angwong, C. Pientong, T. Ekalaksananan [et al.] // Scientific Reports. – 2025. – Vol. 15, N 1. – Art. 45340. https://doi.org/10.1038/s41598-025-29413-4

14. Immune Monitoring Goes Viral – Torque Teno Virus for Immunologic Risk Stratification After Kidney Transplantation / K. Doberer, S. Kapps, F. Haupenthal, G. Bond // Transplant International. – 2025. – Vol. 38. – Art. 15074. https://doi.org/10.3389/ti.2025.15074

15. Understanding torquetenovirus (TTV) as an immune marker / E. J. Gore, L. Gard, H. G. M. Niesters, C. C. Van Leer

16. Buter // Frontiers in Medicine. – 2023. – Vol. 10. – Art. 1168400. https://doi.org/10.3389/fmed.2023.1168400 16. The consortium // TTV GUIDE. – URL: https://www.ttv-guide.eu/team (date of access: 10.02.2026).

17. Investigation of Oral Shedding of Torquetenovirus (TTV) in Moderate-to-Severe COVID-19 Hospitalised Patients / R. A. V. Caixeta, A. M. Batista, M. W. Caetano [et al.] // Viruses. – 2024. – Vol. 16, N 6. – Art. 831. https://doi.org/10.3390/v16060831

18. Respiratory torque teno virus load at emergency department visit predicts intensive care unit admission of SARSCoV-2 infected patients / L. Feghoul, A. Caillault, O. Peyrony [et al.] // Journal of Medical Virology. – 2023. – Vol. 95, N 12. – Art. e29319. https://doi.org/10.1002/jmv.29319

19. Torque Teno Virus Load Is Associated With Centers for Disease Control and Prevention Stage and CD4+Cell Count in People Living With Human Immunodeficiency Virus but Seems Unrelated to AIDS-Defining Events and Human Pegivirus Load / P. Esser, G. Quintanares, B. Langhans [et al.] // The Journal of Infectious Diseases. – 2024. – Vol. 230, N 2. – P. e437– e446. https://doi.org/10.1093/infdis/jiae014

20. TT Virus in the Nasal Secretions of Children with Acute Respiratory Diseases: Relations to Viremia and Disease Severity / F. Maggi, M. Pifferi, C. Fornai [et al.] // Journal of Virology. – 2003. – Vol. 77, N 4. – P. 2418–2425. https://doi.org/10.1128/jvi.77.4.2418-2425.2003

21. Разнообразие праймеров для ПЦР и принципы их подбора / Р. Р. Гарафутдинов, А. Х. Баймиев, Г. В. Малеев [и др.] // Биомика. – 2019. – Т. 11, № 1. – С. 23–70.

22. Субач, М. Ф. Современные методы химической модификации аптамеров и принципы выбора библиотек аптамеров / М. Ф. Субач, М. Г. Хренова, М. Э. Зверева // Вестник Московского университета. Серия 2: Химия. – 2024. – Т. 65, № 2. – С. 78–86.

23. Конструирование праймеров для ПЦР в программе Primer-BLAST / А. А. Козырева, А. М. Злотина, А. С. Головкин [и др.] // Трансляционная медицина. – 2021. – Т. 8, № 3. – С. 37–52. https://doi.org/10.18705/2311-4495-2021-8-3-37-52

24. Метод количественного определения вирусов TTV в биологическом материале Инструкция по применению № 014-0525, 30.06.2025 / О. В. Осипкина, Е. В. Воропаев, А. Н. Рымко [и др.] // MedBY. – URL: http://med.by/methods/book.php?book=3515 (дата обращения: 10.02.2026).

25. Разработка и апробация метода количественного определения ДНК вирусов рода Alphatorquevirus / О. В. Осипкина, Е. В. Воропаев, А. В. Воропаева [и др.] // Лабораторная диагностика. Восточная Европа. – 2025. – Т. 14, № 4. – С. 571–584.

26. Torque teno virus loads and leukocyte populations in stable outpatient solid organ transplant recipients / J. Jonker, C. S. E. Doorenbos, E. J. Gore [et al.] // International Journal of Infectious Diseases. – 2026. – Vol. 162. – Art. 108217. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2025.108217

27. Detection and genetic characterization of the novel torque teno virus group 6 in Taiwanese general population / K.-L. Hsiao, L.-Y. Wang, J.-Ch. Cheng [et al.] // Royal Society Open Science. – 2021. – Vol. 8, N 11. – Art. 210938. https://doi.org/10.1098/rsos.210938

28. Выявление ДНК вирусов TTV и SENV у пациентов с заболеваниями печени и доноров крови / В. М. Мицура, Е. В. Воропаев, О. В. Осипкина [и др.] // Клиническая лабораторная диагностика. Восточная Европа. – 2017. – Т. 6, № 2. – С. 266–275.

29. Torque Teno virus: распространенность и особенности ПЦР-диагностики / О. В. Осипкина, Е. В. Воропаев, В. М. Мицура [и др.] // Проблемы здоровья и экологии. – 2018. ─ Т. 57, № 3. – С. 85–90.

30. Сравнение различных вариантов выявления ДНК вирусов TTV, TTMDV и TTMV / О. В. Осипкина, Е. В. Воропаев, В. М. Мицура [и др.] // Проблемы здоровья и экологии. – 2022. – Т. 19, № 1. – С. 102–108.

31. The Entire Nucleotide Sequence of a TT Virus Isolate from the United States (TUS01): Comparison with Reported Isolates and Phylogenetic Analysis / H. Okamoto, T. Nishizawa, M. Ukita [et al.] // Virology. – 1999. – Vol. 259, N 2. – P. 437–448. https://doi.org/10.1006/viro.1999.9769

32. Development of a minor groove binder assay for real-time PCR detection of porcine Sapelovirus / J. Chen, F. Chen, Q. Zhou [et al.] // Journal of Virological Methods. – 2014. – Vol. 198. – P. 69–74. https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2013.12.003

33. Современные представления о роли torque teno virus (TTV) при заболеваниях печени / И. В. Маев, Т. И. Карлович, А. И. Бурмистров [и др.] // Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. – 2020. – Т. 30, № 4. –С. 7–22.

34. High Torque teno virus viremia predicts long-term mortality and reflects chronic low-grade inflammation (inflammaging) in geriatric inpatients / L. Cianfruglia, G. V. Badillo Pazmay, C. Fortunato [et al.] // Experimental Gerontology. – 2026. – Vol. 213. – Art. 112978. https://doi.org/10.1016/j.exger.2025.112978

35. Assessment of Torquetenominivirus (TTMV) and Torquetenomidivirus (TTMDV) as Complementary Biomarkers to Torquetenovirus (TTV) / L. Cinti, P. G. Spezia, P. Roberto [et al.] // International Journal of Molecular Sciences. – 2025. – Vol. 26, N 3. – Art. 1022. https://doi.org/10.3390/ijms26031022

36. Torque teno virus as a marker of immune status in immunocompromised patients: A systematic review / J. B. Medina, F. F. Vieira e Silva, R. A. V. Caixeta [et al.] // European Journal of Clinical Investigation. – 2025. – Vol. 55, N 8. – Art. e70068. https://doi.org/10.1111/eci.70068

37. Monitoring of Torque Teno virus DNAemia in critically ill COVID-19 patients: May it help to predict clinical outcomes? / L. Forqué, E. Albert, E. Giménez [et al.] // Journal of Clinical Virology. – 2022. – Vol. 148. – Art. 105082. https://doi.org/10.1016/j.jcv.2022.105082