THE ASSESSMENT OF ISSR MARKERS APPLICATION TO GENETIC TYPING AND CERTIFICATION OF VACC INIUM PLANTS
Abstract
Genotypes of four Vaccinium corymbosum cultivars and two cultivars of V. angustifolium × V. corymbosum, along with wild individuals of V. myrtillus, were analyzed using five inter-simple sequence repeat (ISSR) primers (UBC 808, 818, 824, 845, 867). The primers produced 128 bands on the whole; 22.7 % of the bands were common to all blueberry cultivars. In the case of V. myrtillus, 68.0 % of its bands were identical with monomorphic bands in cultivated blueberries. The obtained sets of consistent bands can be considered as cultivar passports and they can be used for Vaccinium cultivars certification. Cluster analysis of genetic similarity between cultivars, based on ISSR profiles, is provided.
References
1. Титок, В. В. Голубика высокорослая – инновационная культура премиум-класса / В. В. Титок, А. А. Веевник, Н. Б. Павловский // Голубиководство в Беларуси: итоги и перспективы: материалы Респ. науч.-практ. конф., Минск, 17 авг. 2012 г. / Центр. бот. сад НАН Беларуси, редкол.: В. В. Титок (отв. ред.) [и др.]. – Минск, 2012. – C. 5–8.
2. Бобошина, И. В. Идентификация перспективных для Урала сортов пшеницы мягкой с использованием межмикросателлитного анализа полиморфизма ДНК / И. В. Бобошина, С. В. Боронникова // Фунд. исслед. – 2013. – № 6 (1). – С. 92–97.
3. Карлов, Г. И. Молекулярно-генетические и молекулярно-цитогенетические подходы для ускоренного создания селекционного материала растений с заданными свойствами: автореф. дис. … д-ра биол. наук: 03.00.23 / Г. И. Карлов; Рос. гос. аграр. ун- т. – М., 2009. – 50 с.
4. Оценка генетической разнородности линий томата на основе технологии ISSR-PCR / В. Н. Кавцевич [и др.] // Вес. БДПУ. Сер. 3. – 2013. – № 3. – С. 18–23.
5. Сравнительный анализ методов экстракции общей геномной ДНК голубики высокорослой / Н. В. Водчиц [и др.] // Весн. Палеск. дзярж. ун-та. Сер. прыродазнаўч. навук. – 2014. – № 2. – С. 25–30.
6. Rapid DNA extraction from ferns for PCR-based analyses / E. L. Dempster [et al.] // Biotechnique. – 1999. – Vol. 27, N 1. – P. 66–68.
7. Водчиц, Н . В. Выявление генетической разнородности сортов голубики методом ISSR-маркирования / Н. В. Водчиц, Е. О. Юрченко, А. А. Волотович // Инновационные технологии в науке и образовании: материалы IV Междунар. науч.-практ. конф., Чебоксары, 18 дек. 2015 г. / редкол.: О. Н. Широков (отв. ред.) [и др.]. – Чебоксары: ЦНС «Интерактив плюс», 2015. – № 4 (4). – С. 15–19.
8. Сертификация сортов голубики высокой (Vaccinium corymbosum L.), районированных в Беларуси, на основе RAPD- и ISSR-маркеров / А. Б. Власова [и др.] // Вісн. Укр. тов-ва генетиків і селекціонерів. – 2010. – Т. 8, № 2. – С. 203–210.
9. Debnath, S. C. Development of ISSR markers for genetic diversity studies in Vaccinium angustifolium / S. C. Debnath // Nordic J. Bot. – 2009. – Vol. 27, N 2. – Р. 141–148.
10. Application of inter-simple sequence repeats relative to simple sequence repeats as a molecular marker system for indexing blueberry cultivars / M. Garriga [et al.] // Can. J. Plant Sci. – 2013. – Vol. 93, N 5. – Р. 913–921.
11. Леончик, Е. Ю. Кластерный анализ: терминология, методы, задачи / Е. Ю. Леончик; ОНУ им. И. И. Мечникова, ИМЭМ . – 2-е изд., испр. и доп. – Одесса, 2011. – 67 с.
Review
Views: 650
Email this article 
