Preview

Известия Национальной академии наук Беларуси. Серия биологических наук

Пашыраны пошук

Построение прогноза накопления 137Cs древесными растениями и сельскохозяйственными культурами с использованием метода решающих деревьев

https://doi.org/10.29235/1029-8940-2024-69-3-237-248

Анатацыя

Изучены закономерности накопления 137Cs в стволовой древесине сосновых насаждений и в урожае сельскохозяйственных культур с использованием метода градиентного бустинга на решающих деревьях и SHAP-анализа. Для сосновых насаждений в зоне отчуждения Чернобыльской АЭС выявлена нелинейная связь коэффициента перехода с высотой над уровнем моря, а также с вегетационными индексами, указывающими на общее состояние насаждений, их биологическую продуктивность и обеспеченность калием. В агроэкосистемах на территории Гомельской и Могилевской областей подтверждено влияние на коэффициент перехода вида растения и концентрации K+ в почвенном растворе. Использование интерпретируемого метода машинного обучения позволило определить характер влияния дефицита почвенной влаги на накопление 137Cs сельскохозяйственными растениями, а также показать сохранение вклада трансфолиарного поступления радионуклида при низких уровнях загрязнения почвы на этапе отдаленных последствий радиоактивных выпадений. Применение метода градиентного бустинга на решающих деревьях и интерпретация модели с помощью SHAP-анализа обеспечили более глубокое понимание сложных взаимосвязей факторов, влияющих на поступление 137Cs в растения, что открывает перспективы для повышения точности прогноза загрязнения растительных ресурсов радионуклидами.

Аб аўтарах

А. Никитин
Институт микробиологии НАН Беларуси
Беларусь


М. Кудин
Полесский государственный радиационно-экологический заповедник
Беларусь


С. Калиниченко
Полесский государственный радиационно-экологический заповедник
Беларусь


Т. Ласько
Институт радиобиологии НАН Беларуси
Беларусь


О. Шуранкова
Институт радиобиологии НАН Беларуси
Беларусь


Е. Мищенко
Институт радиобиологии НАН Беларуси
Беларусь


Спіс літаратуры

1. Debeljak, M. Decision trees in ecological modelling / M. Debeljak, S. Džeroski // Modelling complex ecological dynamics: An introduction into ecological modelling for students, teachers & scientists / ed.: F. Jopp [et al.]. – Heidelberg, 2011. – P. 197–209.

2. Zhang, B. Modelling the productivity of naturalised pasture in the North Island, New Zealand: a decision tree approach / B. Zhang, I. Valentine, P. Kemp // Ecol. Modelling. – 2005. – Vol. 186, N 3. – P. 299–311. https://doi.org/10.1016/j.ecolmodel.2004.12.016

3. Prediction of phytoplankton biomass and identification of key influencing factors using interpretable machine learning models / Y. Xu [et al.] // Ecolog. Indicators. – 2024. – Vol. 158. – Art. 111320. https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2023.111320

4. Prediction and analysis of net ecosystem carbon exchange based on gradient boosting regression and random forest / J. Cai [et al.] // Appl. Energy. – 2020. – Vol. 262. – Art. 114566. https://doi.org/10.1016/j.apenergy.2020.114566

5. Predictive models for the effect of environmental factors on the abundance of vibrio parahaemolyticus in oyster farms in taiwan using extreme gradient boosting / N. Ndraha [et al.] // Food Control. – 2021. – Vol. 130. – Art. 108353. https://doi.org/10.1016/j.foodcont.2021.108353

6. Golden, C. E. Comparison between random forest and gradient boosting machine methods for predicting Listeria spp. prevalence in the environment of pastured poultry farms / C. E. Golden, M. J. Rothrock, A. Mishra // Food Res. Int. – 2019. – Vol. 122. – P. 47–55. https://doi.org/10.1016/j.foodres.2019.03.062

7. Techniques to improve ecological interpretability of black-box machine learning models / T. Welchowski [et al.] // J. Ag., Biol. Envir. St. – 2021. – Vol. 27, N 1. – P. 175–197. https://doi.org/10.1007/s13253-021-00479-7

8. Konoplev, A. Mobility and bioavailability of the Chernobyl-derived radionuclides in soil-water environment: Review / A. Konoplev // Behavior of radionuclides in the environment II: Chernobyl / ed. by A. Konoplev, K. Kato, S. N. Kalmykov. – Singapore, 2020. – P. 157–193. https://doi.org/10.1007/978-981-15-3568-0_3

9. Мирошников, В. Справочник таксатора / В. Мирошников, О. Труль, В. Ермаков. ‒ Минск: Ураджай, 1980. – 359 с.

10. Радиационный контроль. Обследование лесосек. Порядок проведения: ТКП 239.2010 (02080). Введ. 01.06.2010 / М-во лесн. хоз-ва Респ. Беларусь. – Минск: М-во лесн. хоз-ва Респ. Беларусь, 2010. – 22 с.

11. Практикум по агрохимии: учеб. пособие / О. А. Амельянчик [и др.]; под ред. В. Минеева. ‒ 2-е изд., перераб. и доп. – М.: Изд-во МГУ, 2001. – 689 с.

12. Gilmore, G. R. Practical gamma-ray spectrometry / G. R. Gilmore. ‒ 2nd ed. – John Wiley & Sons, 2008. – 387 p.

13. Tarsitano, D. Evaluating and reducing a model of radiocaesium soil-plant uptake / D. Tarsitano, S. Young, N. Crout // J. Environ. Radioactiv. – 2011. – Vol. 102, N 3. – P. 262–269. https://doi.org/10.1016/j.jenvrad.2010.11.017

14. Deriving probabilistic soil distribution coefficients (Kd). Part 2: Reducing caesium Kd uncertainty by accounting for experimental approach and soil properties / Ramírez-Guinart O. [et al.] // J. Environ. Radioactiv. – 2020. – Vol. 223–224. – Art. 106407. https://doi.org/10.1016/j.jenvrad.2020.106407

15. Sheppard, S. C. Robust prediction of Kd from soil properties for environmental assessment / S. C. Sheppard // Hum. Ecol. Risk Assess. – 2011. – Vol. 17, N 1. – P. 263–279. https://doi.org/10.1016/j.jenvrad.2020.106407

16. Sentinel-2: ESA’s optical high-resolution mission for GMES operational services / M. Drusch [et al.] // Remote Sensing Environ. – 2012. – Vol. 120. – P. 25–36. https://doi.org/10.1016/j.rse.2011.11.026

17. ALOS World 3D 30-meter DEM. V3.2 [Electronic resource] / JAEA 2021. – Mode of access: https://doi.org/10.5069/G94M92HB. – Date of access: 17.11.2021.

18. Version 4 of the SMAP level‐4 soil moisture algorithm and data product / R. H. Reichle [et al.] // J. Adv. Model. Earth Syst. – 2019. – Vol. 11, N 10. – P. 3106–3130. https://doi.org/10.1029/2019MS001729

19. Lightgbm: A highly efficient gradient boosting decision tree [Electronic resource] / G. Ke [et al.] // Advances in Neural Information Processing Systems 30 (NIPS 2017) / ed. by I. Guyon [et al.]. – Mode of access: https://proceedings.neurips.cc/paper_files/paper/2017/file/6449f44a102fde848669bdd9eb6b76fa-Paper.pdf. – Date of access: 31.05.2024.

20. Snoek, J. Practical bayesian optimization of machine learning algorithms [Electronic resource] / J. Snoek, H. Larochelle, R. P. Adams // Proceedings of the 25th International conference on neural information processing systems: in 2 vol. – Lake Tahoe, Nevada: Curran Associates Inc., 2012. – Vol. 2. – P. 2951–2959. Mode of access: https://dl.acm.org/doi/10.5555/2999325.2999464. – Date of access: 31.05.2024.

21. Explainable machine-learning predictions for the prevention of hypoxaemia during surgery / S. M. Lundberg [et al.] // Nat. Biomed. Engin. – 2018. – Vol. 2, N 10. – P. 749–760. https://doi.org/10.1038/s41551-018-0304-0

22. From local explanations to global understanding with explainable AI for trees / S. M. Lundberg [et al.] // Nat. Machine Intel. – 2020. – Vol. 2, N 1. – P. 56–67. https://doi.org/10.1038/s42256-019-0138-9

23. Анализ возможности использования спутниковых данных для прогноза параметров перехода радиоактивных изотопов цезия из почвы в древесные растения / А. Н. Никитин А. [и др.] // Восьмой белорусский космический конгресс: материалы, 25‒27 окт. 2022 г., г. Минск: в 2 т. / науч. ред.: С. В. Кругликов, И. В. Филипченко. – Минск, 2022. – Т. 1. – С. 245–249.

24. The high affinity K+ transporter AtHAK5 plays a physiological role in planta at very low K+ concentrations and provides a caesium uptake pathway in arabidopsis / Z. Qi [et al.] // J. Exp. Bot. – 2008. – Vol. 59, N 3. – P. 595–607. https://doi.org/10.1093/jxb/erm330

25. Экспериментальная оценка влияния режима увлажнения почвы на накопление 137Cs побегами яровой пшеницы / А. Н. Никитин [и др.] // Вес. Нац. акад. навук Беларусі. Сер. біял. навук. – 2020. – Т. 65, № 2. – P. 229–238.

26. Nikitin, A. N. Impact of soil moisture on cesium uptake by plants: Model assessment / A. N. Nikitin // J. Environ. Radioactiv. – 2021. – Vol. 240. – Art. 106754. https://doi.org/10.1016/j.jenvrad.2021.106754

27. Smolders, E. Concentrations of 137Cs and K in soil solution predict the plant availability of 137Cs in soils / E. Smolders, K. Van den Brande, R. Merckx // Environ. Sci. Technol. – 1997. – Vol. 31, N 12. – P. 3432–3438. https://doi.org/10.1021/es970113r


##reviewer.review.form##

Праглядаў: 186


Creative Commons License
Кантэнт даступны пад ліцэнзіяй Creative Commons Attribution 3.0 License.


ISSN 1029-8940 (Print)
ISSN 2524-230X (Online)