Распространение рBS72-подобных конъюгативных плазмид среди природных бактерий рода Bacillus
https://doi.org/10.29235/1029-8940-2022-67-2-219-228
Анатацыя
В результате проведенного исследования в изолированных из разных природных источников на территории Беларуси почвенных образцах, содержащих бактерии B. subtilis, с частотой 27 % (в 22 образцах из 36 исследованных) выявлены рBS72-подобные репликоны. На основе 99–100 %-ного сходства белков, ответственных за репликацию (Rep-белки) и конъюгацию (белки VirB4, VirB6, VirB11, VirD4, Mob), установлено, что pBS72подобные конъюгативные плазмиды присутствуют в клетках природных бактерий B. subtilis, циркулирующих на территории Пакистана, Китая и Нидерландов, а также в клетках бактерий B. rugosus, изолированных на территории Индии. Сходные репликоны (Rep-белки идентичны на 62 %), способные передаваться путем конъюгации (ключевые белки конъюгации идентичны на 60–80 %), обнаружены в бактериях Bacillus sp., B. licheniformis, B. paralicheniformis и B. subtilis, выделенных в США, Австралии, Китае и Южной Корее.
Аб аўтарах
А. ГуриновичБеларусь
Н. Сацункевич
Беларусь
М. Титок
Беларусь
Спіс літаратуры
1. Antibiotic production and biocontrol activity by Bacillus subtilis CL27 and Bacillus pumilus CL45 / C. Leifert [et al.] // J. Appl. Bacteriol. – 1995. ‒ Vol. 78, N 2. – P. 97–108. https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.1995.tb02829.x
2. Schallmey, M. Developments in the use of Bacillus species for industrial production / M. Schallmey, A. Singh, O. P. Ward // Can. J. Microbiol. – 2004. ‒ Vol. 50, N 1. – P. 1–17. https://doi.org/10.1139/w03-076
3. Rolling-circle plasmids from Bacillus subtilis: complete nucleotide sequences and analyses of genes of pTA1015, pTA1040, pTA1050 and pTA1060, and comparisons with related plasmids from gram-positive bacteria / W. J. Meijer [et al.] // FEMS Microbiol. Rev. – 1998. – Vol. 21, N 4. – P. 337–368. https://doi.org/10.1111/j.1574-6976.1998.tb00357.x
4. Bacillus subtilis soil isolates: plasmid replicon analysis and construction of a new theta-replicating vector / M. A. Titok [et al.] // Plasmid. – 2003. – Vol. 49, N 1. – P. 53–62. https://doi.org/10.1016/s0147-619x(02)00109-9
5. Plasmid transfer in Bacilli by a self-transmissible plasmid p19 from a Bacillus subtilis soil strain / E. U. Poluektova [et al.] // Plasmid. – 2004. – Vol. 52, N 3. – P. 212–217. https://doi.org/10.1016/j.plasmid.2004.07.001
6. Secondary metabolite production and the safety of industrially important members of the Bacillus subtilis group / C. R. Harwood [et al.] // FEMS Microbiol. Rev. – 2018. – Vol. 42, N 6. – P. 721–738. https://doi.org/10.1093/femsre/fuy028
7. te Riele, H. Single-stranded plasmid DNA in Bacillus subtilis and Staphylococcus aureu / H. te Riele, B. Michel, S. D. Ehrlich // Proc. Nat. Acad. Sci. USA. – 1986. – Vol. 83, N 8. – P. 2541–2545. https://doi.org/10.1073/pnas.83.8.2541
8. Маниатис, Т. Методы генетической инженерии: молекулярное клонирование / Т. Маниатис, Э. Фрич, Дж. Сэмбрук ; пер. с англ. под ред. А. А. Баева, К. Г. Скрябина. – М. : Мир, 1984. – 479 с.
9. Mauve: multiple alignment of conserved genomic sequence with rearrangements / A. C. E. Darling [et al.] // Genome Res. ‒ 2004. – Vol. 14, N 7. – P. 1394–1403. https://doi.org/10.1101/gr.2289704
10. Титок, М. А. Плазмидный состав бактерий Bacillus subtilis, выделенных из природных источников / М. А. Титок, А. В. Лагодич, Ю. В. Селезнева // Вестн. БГУ. Сер. 2. – 2003. – № 3. – С. 35–38.
11. Bacillus subtilis soil isolates: plasmid replicon analysis and construction of a new theta-replicating vector / M. A. Titok [et al.] // Plasmid. – 2003. – Vol. 49, N 1. – P. 53–62. https://doi.org/10.1016/s0147-619x(02)00109-9
12. Integrated metagenomics and network analysis of soil microbial community of the forest timberline / J. Ding [et al.] // Sci. Reports. – 2015. – Vol. 5. – Art. 7994. https://doi.org/10.1038/srep07994
13. Microbial diversity of a mediterranean soil and its changes after biotransformed dry olive residue amendment / J. A. Siles [et al.] // PLoS ONE. – 2014. – Vol. 9, N 7. – P. e103035. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0103035
14. Гуринович, А. С. Молекулярно-генетический и функциональный анализ плазмиды pBS72 природных бактерий Bacillus subtilis / А. С. Гуринович, М. А. Титок // Микробиология. – 2020. – Т. 89, № 6. – С. 646–657.
15. Draft genome sequences of 10 Bacillus subtilis strains that form spores with high or low heat resistance / E. M. Berendsen [et al.] // Genome Announc. – 2016. ‒ Vol. 4, N 2. – P. e00124‒16. https://doi.org/10.1128/genomeA.00124-16