Генетическое разнообразие энтеровирусов у пациентов с респираторными формами инфек- ции

Генетическая вариабельность энтеровирусов (ЭВ) лежит в основе многообразия клинических форм вызываемых ими заболеваний. Целью настоящего исследования было установление генетического разнообразия ЭВ, вызвавших острую респираторную инфекцию (ОРИ) в 2016–2019 гг. Биологический материал получен от 203 пациентов с различными формами ОРИ. Детекцию ЭВ осуществляли в ОТ-ПЦР с последующим секвенированием гена основного капсидного белка и филогенетической реконструкцией. РНК ЭВ обнаружена в 34,4 % образцов, чаще всего у детей 1–6 лет (53,1–54,8 %). Вирусы Коксаки В встречались у пациентов с респираторной энтеровирусной инфекцией (ЭВИ) достоверно чаще, чем другие ЭВ, доминирующими серотипами были Коксаки В4, В5. Несмотря на значительное генетическое многообразие ЭВ, идентифицированных у пациентов с ОРИ (три генетические линии Коксаки В5, два генотипа Коксаки В2, один генотип Коксаки В3, три геноварианта Коксаки В4, один геновариант Коксаки В1), их связь с формированием именно респираторной формы ЭВИ не доказана. 

Высокий уровень генетической изменчивости ЭВ диктует необходимость регулярного молекулярно-эпидемиологического мониторинга возбудителей для своевременной идентификации новых генетических вариантов и оценки их эпидемического потенциала.

1. Recommendations for the nomenclature of enteroviruses and rhinoviruses / P. Simmonds [et al.] // Arch. Virol. – 2020. – Vol. 165, N 6. – P. 1515. https://doi.org/10.1007/s00705-020-04558-x

2. Muehlenbachs, A. Tissue tropism, pathology and pathogenesis of enterovirus infection / A. Muehlenbachs, J. Bhatnagar, S. Zaki // J. Pathol. – 2015. – Vol. 235, N 2. – P. 217–228. https://doi.org/10.1002/path.4438

3. Молекулярная эпидемиология энтеровирусов, вызывающих тяжелые неврологические формы инфекции / Н. В. Поклонская [и др.] // Вес. Нац. акад. наук Беларусі. Сер. мед. навук. – 2017. – № 3. – С. 29–36.

4. Kumar, S. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets / S. Kumar, G. Stecher, K. Tamura // Mol. Biol. Evol. – 2016. – Vol. 33, N 7. – P. 1870–1874. https://doi.org/10.1093/molbev/msw054

5. Генетическое разнообразие эпидемически значимых возбудителей энтеровирусной инфекции / Н. В. Поклонская [и др.] // Мол. медицина. – 2011. – № 3. – C. 45–53.

6. Phylogenetic patterns of human coxsackievirus B5 arise from population dynamics between two genogroups and reveal evolutionary factors of molecular adaptation and transmission / C. Henquell [et al.] // J. Virol. – 2013. – Vol. 87, N 22. – P. 12249–12259. https://doi.org/10.1128/jvi.02075-13

7. Phylodynamic reconstruction of the spatiotemporal transmission and demographic history of coxsackievirus B2 / H. W. Huang [et al.] // BMC Bioinformatics. – 2015. – Vol. 16, N 1. – Art. 302. https://doi.org/10.1186/s12859-015-0738-2

8. Two сoxsackievirus B3 outbreaks associated with hand, foot, and mouth disease in China and the evolutionary history worldwide / Z. Han [et al.] // BMC Infect. Dis. – 2019. – Vol. 19, N 1. – Art. 466. https://doi.org/10.1186/s12879-019-4107-z

9. Pallansch, M. Enteroviruses: polioviruses, coxsackieviruses, echoviruses, and newer enteroviruses / M. Pallansch, R. Roos // Fields Virology / eds. D. M. Knipe, P. M. Howley. – 5th ed. – Philadelphia, 2007. – P. 839–893.

10. Xiang, Z. Enterovirus D68 and human respiratory infections / Z. Xiang, J. Wang // Semin. Respir. Crit. Care Med. – 2016. – Vol. 37, N 4. – P. 578–585. https://doi.org/10.1055/s-0036-1584795

11. Genetic diversity of respiratory enteroviruses and rhinoviruses in febrile adults, Singapore, 2007–2013 / M. Linster [et al.] // Influenza Other Respir. Viruses. – 2020. – Vol. 14, N 1. – P. 67–71. https://doi.org/10.1111/irv.12662

12. Enteroviruses and rhinoviruses: molecular epidemiology of the most influenza-like illness associated viruses in Senegal / A. Fall [et al.] // Am. J. Trop. Med. Hyg. – 2016. – Vol. 95, N 2. – P. 339–347. https://doi.org/10.4269/ajtmh.15-0799