Ген яблони MD13G1109800 относится к транскрипционным факторам се- мейства Trihelix и экспрессируется в ответ на воздействие абиотических стрессовых факторов

В ответе растения на различные виды абиотического стресса важную роль играет семейство транскрипционных факторов Trihelix. В представленной работе методами биоиформатики в геноме яблони сорта Golden Delicious in silico был идентифицирован ген MD13G1109800, принадлежащий к этому семейству. Анализ хромосомной локализации показал, что он расположен на 13-й хромосоме и имеет четыре интрона. Кодируемый им гипотетический белок имеет длину 365 аминокислотных остатков, молекулярную массу 42097,23 Да, изоэлектрическую точку pI = 6,21. Оценка его внутриклеточной локализации показала, что он находится в ядре. Анализ промоторной области гена MD13G1109800 указывает на то, что кодируемый им белок является участником множества сигнальных путей, запускаемых как внешними, так и внутренними факторами. Уровень экспрессии гена MD13G1109800 у подвоя яблони ММ-106 возрастает при воздействии засухи, низкой и высокой температуры, засоления.

1. Ingram, J. The molecular basis of dehydration tolerance in plants / J. Ingram, D. Bartels // Ann. Rev. Plant Physiol.

2. Plant Mol. Biol. – 1996. – Vol. 47, N 1. – P. 377–403. https://doi.org/10.1146/annurev.arplant.47.1.377

3. Shinozaki, K. Gene expression and signal transduction in water-stress response / K. Shinozaki, K. YamaguchiShinozaki // Plant Physiol. – 1997. – Vol. 115, N 2. – P. 327–334. https://doi.org/10.1104/pp.115.2.327

4. Shinozaki, K. Molecular responses to dehydration and low temperature: differences and cross-talk between two stress

5. signaling pathways / K. Shinozaki, K. Yamaguchi-Shinozaki // Curr. Opin. Plant Biol. – 2000. – Vol. 3, N 3. – P. 217–223.

6. https://doi.org/10.1016/s1369-5266(00)80068-0

7. Genome-wide characterization and identification of trihelix transcription factor and expression profiling in response to

8. abiotic stresses in rice (Oryza sativa L.) / J. Li [et al.] // Int. J. Mol. Sci. – 2019. – Vol. 20, N 3. – P. 251. https://doi.org/10.3390/

9. ijms20020251

10. Murata, J. Characterization of a novel GT-box binding protein from Arabidopsis / J. Murata, H. Takase, K. Hiratsuka //

11. Plant Biotechnol. – 2002. – Vol. 19, N 2. – P. 103–112. https://doi.org/10.5511/plantbiotechnology.19.103

12. Soybean trihelix transcription factors GmGT-2A and GmGT-2B improve plant tolerance to abiotic stresses in transgenic Arabidopsis / Z.-M. Xie [et al.] // PLoS ONE. – 2009. – Vol. 4, N 9. – P. e6898. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0006898

13. Repression of seed maturation genes by a trihelix transcriptional repressor in Arabidopsis seedlings / M. J. Gao [et al.] //

14. Plant Cell. – 2009. – Vol. 21, N 1. – P. 54–71. https://doi.org/10.1105/tpc.108.061309

15. Genome-wide identification and expression profiling analysis of trihelix gene family in tomato / C. Yu [et al.] //

16. Biochem. Biophys. Res. Commun. – 2015. – Vol. 468, N 4. – P. 653–659. https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2015.11.010

17. The Pfam protein families database in 2019 / S. El-Gebali [et al.] // Nucl. Acids Res. – 2018. – Vol. 47, N D1. – P. D427–

18. D432. https://doi.org/10.1093/nar/gky995

19. Isolation of high quality RNA from bilberry (Vaccinium myrtillus L.) fruit / L. Jaakola [et al.] // Mol. Biotechnol. –

20. – Vol. 19, N 2. – P. 201–203. https://doi.org/10.1385/MB:19:2:201

21. The MIQE guidelines: minimum information for publication of quantitative real-time PCR experiments / S. A. Bustin

22. [et al.] // Oxford University Press. – 2009. – Vol. 55, N 4. – P. 611–622. https://doi.org/10.1373/clinchem.2008.112797

23. Genome-wide analysis and expression profiling of the DREB transcription factor gene family in Malus under abiotic

24. stress / T. Zhao [et al.] // Mol. Genet. Genomics. – 2012. – Vol. 287, N 5. – P. 423–436. https://doi.org/10.1007/s00438-012-0687-7

25. An improvement of the 2ˆ (–delta delta CT) method for quantitative real-time polymerase chain reaction data analysis /

26. X. Rao [et al.] // Biostat, Bioinform Biomath. – 2013. – Vol. 3, N 3. – P. 71–85.

27. Genome-wide identification and characterization of WRKY transcriptional factor family in apple and analysis

28. of their responses to waterlogging and drought stress / D. Meng [et al.] // Plant Physiol. Biochem. – 2016. – Vol. 103. –

29. P. 71–83. https://doi.org/10.1016/j.plaphy.2016.02.006

30. The jasmonate-activated transcription factor MdMYC2 regulates ethylene response factor and ethylene biosynthetic

31. genes to promote ethylene biosynthesis during apple fruit ripening / T. Li [et al.] // Plant Cell. – 2017. – Vol. 29, N 6. –

32. P. 1316–1334. https://doi.org/10.1105/tpc.17.00349

33. Genome-wide identification of trihelix genes in moso bamboo (Phyllostachys edulis) and their expression in response

34. to abiotic stress / H. Gao [et al.] // J. Plant Growth Reg. – 2019. – Vol. 38. – P. 1127–1140. https://doi.org/10.1007/s00344-019-

35. -9