Оценка генетической изменчивости белорусских популяций офрис насекомоносной (Ophrys insectifera L.) с использованием молекулярных iPBS-маркеров
https://doi.org/10.29235/1029-8940-2021-66-2-223-231
Анатацыя
Проведен анализ генетической гетерогенности двух популяций офрис насекомоносной (Ophrys insectifera L.), произрастающих в Лепельском районе (Березинский биосферный заповедник) и в Ушачском районе (окрестности д. Веркуды). Вид имеет I категорию охраны (CR – критическая угроза исчезновения). Результаты, полученные с помощью использования iPBS-маркеров, показали, что у популяции из д. Веркуды более высокий уровень генетической гетерогенности, чем у популяции из Березинского биосферного заповедника. Анализ молекулярной вариансы (AMOVA) показал, что основная доля генетической изменчивости является внутрипопуляционной (64 %). Определен коэффициент генетической дифференциации популяций (Gst = 0,26). Анализ главных координат (PCoA) выявил две группы, которые совпадали с природными популяциями, и подтвердил большую генетическую гетерогенность у популяции из д. Веркуды.
Аб аўтарах
Н. Самохвалова
Центральный ботанический сад НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
А. Кручонок
Центральный ботанический сад НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Б. Аношенко
Центральный ботанический сад НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
В. Титок
Центральный ботанический сад НАН Беларуси
Беларусь
Беларусь
Спіс літаратуры
1. Population extinctions driven by climate change, population size, and time since observation may make rare species databases inaccurate / T. N. Kaye [et al.] // PLoS ONE. – 2019. – Vol. 14, N 10. – P. e0210378 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0210378
2. Hamouda, M. Molecular analysis of genetic diversity in population of Silybum marianum (L.) Gaertn in Egypt / M. Hamouda // J. Gen. Eng. Biotechnol. – 2019. – Vol. 17, N 1. – Art. 12. https://doi.org/10.1186/s43141-019-0011-6
3. Neel, M. C. Conservation of genetic diversity in the endangered plant Eriogonum ovalifolium var. vineum (Polygonaceae) / M. C. Neel, N. C. Ellstrand // Conservation Genetics. – 2003. – Vol. 4, N 3. – P. 337–352. https://doi.org/10.1023/A:1024017029933
4. Genetic diversity and population structure of the rare and endangered plant species Pulsatilla patens (L.) Mill in East Central Europe / M. Szczecińska [et al.] // PloS ONE. – 2016. – Vol. 11, N 3. – P. e0151730. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0151730
5. Красная книга Республики Беларусь. Растения: редкие и находящиеся под угрозой исчезновения виды дикорастущих растений / И. М. Качановский [и др.]. – 4-е изд. – Минск : Беларус. энцыкл., 2015. – 448 с.
6. Созинов, О. В. Ophrys insectifera L. – новый вид сем. Orchidaceae для флоры Беларуси / О. В. Созинов // Ботаника (исследования) : сб. науч. тр. / Ин-т эксперим. бот. НАН Беларуси. – Минск, 2010. – Вып. 38. – С. 428–431.
7. Оценка морфо-экологических характеристик Ophrys insectifera L. двух удаленных ценопопуляций / А. В. Кручонок [и др.] // Мониторинг и оценка состояния растительного мира : материалы 5-й Междунар. науч. конф. (Беларусь, Минск, Беловежская пуща, 8–12 октября 2018 г.). – Минск, 2018. – С. 246–248.
8. Sanford, M. The Orchids of Suffolk / M. Sanford. – Ipswich : Suffolk Naturalists Society, 1991. – 123 p.
9. An efficient protocol for total DNA extraction from the members of order Zingiberales-suitable for diverse PCR based downstream applications / K. D. Devi [et al.] // SpringerPlus. – 2013. – Vol. 2. – Art. 669. https://doi.org/10.1186/2193-1801-2-669
10. DNA molecular markers in plant breeding: current status and recent advancements in genomic selection and genome editing / M. A. Nadeem [et al.] // Biotechnol. Biotechnol. Equipment. – 2018. – Vol. 32, N 2. – P. 261–285. https://doi.org/10.1080/13102818.2017.1400401
11. IPBS: a universal method for DNA fingerprinting and retrotransposon isolation / R. Kalendar [et al.] // Theor. Appl. Gen. – 2010. – Vol. 121, N 8. – P. 1419–1430. https://doi.org/10.1007/s00122-010-1398-2
12. Mobile genomic element diversity in world collection of safflower (Carthamus tinctorius L.) panel using iPBS-retrotransposon markers / F. Ali [et al.] // PLoS ONE. – 2019. – Vol. 14, N 2. – P. e0211985. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0211985
13. AFLP markers reveal high polymorphic rates in ryegrass (Lolium spp.) / I. Roldán-Ruiz [et al.] // Mol. Breeding. – 2000. – Vol. 6. – P. 125–134. https://doi.org/10.1023/A:1009680614564
14. Genetic diversity and population structure of naturally rare Calibrachoa species with small distribution in southern Brazil / A. L. de Wallau John [et al.] // Gen. Mol. Biol. – 2019. – Vol. 42, N 1. – P. 108–119. https://doi.org/10.1590/1678-4685-gmb-2017-0314
15. Зарецкая, М. В. Генетическое разнообразие и популяционная структура вида Arabidopsis thaliana (L.) Heynh. острова Валаам / М. В. Зарецкая, О. М. Федоренко // Тр. Карельск. науч. центра Рос. акад. наук. – 2016. – № 11. – С. 9–16.
16. Analysis of genetic population structure and diversity in Mallotus oblongifolius using ISSR and SRAP markers / W. Yan [et al.] // PeerJ. – 2019. – Vol. 7. – P. e7173. https://doi.org/10.7717/peerj.7173
17. Changing world: challenges for landscape research / ed. : F. Kienast, O. Wildi, S. Ghosh. ‒ Вerlin : Springer, 2007. – 297 p.
18. Resmi, L. Population genetic structure and diversity analysis of South Indian banana cultivars / L. Resmi, A. R. Nair, A. S. Nair // J. Plant Breed. Crop Sci. – 2016. – Vol. 8, N 1. – P. 1–12. https://doi.org/10.5897/jpbcs2015.0519
19. Дьяконов, В. П. Matlab 6.5 SP1/7/7 SP1/7 SP2 + Simulink 5/6. Инструменты искусственного интеллекта и биоинформатики / В. П. Дьяконов, В. В. Круглов. ‒ M. : Солон Пресс, 2020. – 454 c.
##reviewer.review.form##
Праглядаў: 702
Паслаць артыкул па эл. пошце 
