Изучение генофонда озимой ржи Secale cereale L. Республики Беларусь с применением микросателлитных маркеров
https://doi.org/10.29235/1029-8940-2021-66-2-215-222
Аннотация
В настоящей работе с использованием 15 микросателлитных (SSR) маркеров исследовано генетическое разнообразие современного генофонда селекционных образцов озимой ржи (S. cereale L.) Республики Беларусь с целью разработки дивергентных комбинаций скрещивания при селекции на гетерозис. Показано, что сформированный набор SSR-маркеров высокоэффективен ‒ индекс информативности (PIC) варьировался от 0,50 до 0,83 и составил в среднем 0,72. Выявлены наиболее эффективные микросателлитные маркеры (SCM28, SCM43, SCM101 и SCM102), которые могут успешно использоваться для изучения генетического разнообразия ржи. Установлено, что современный генофонд озимой ржи Республики Беларусь характеризуется широким генетическим разнообразием (межпопуляционной изменчивостью) – все коллекционные образцы имеют уникальный аллельный состав изученных микросателлитных локусов. На основе результатов исследований построена дендрограмма иерархической кластеризации, позволившая определить наиболее генетически дивергентные комбинации скрещиваний. Полученные данные могут быть использованы в практической селекции ржи на гетерозис для разработки эффективной схемы создания новых сортов и гибридов.
Об авторах
В. С. МандрусоваБеларусь
Мандрусова Виктория Сергеевна, мл. науч. cотрудник
ул. Академическая, 27, 220072, г. Минск
И. С. Гордей
Беларусь
Гордей Игорь Станиславович, канд. биол. наук, ст. науч. сотрудник
ул. Академическая, 27, 220072, г. Минск
О. М. Люсиков
Беларусь
Люсиков Олег Михайлович, науч. сотрудник
ул. Академическая, 27, 220072, г. Минск
В. Е. Шимко
Беларусь
Шимко Виктория Евгеньевна, науч. сотрудник
ул. Академическая, 27, 220072, г. Минск
И. А. Гордей
Беларусь
Гордей Иван Андреевич, д-р биол. наук, профессор, гл. науч. сотрудник
ул. Академическая, 27, 220072, г. Минск
Список литературы
1. Урбан, Э. П. Озимая рожь в Беларуси: селекция, семеноводство, технология возделывания / Э. П. Урбан. – Минск : Беларус. навука, 2009. – 269 с.
2. Кобылянский, В. Д. Теоретические основы селекции зернофуражной ржи с низким содержанием водорастворимых пентозанов / В. Д. Кобылянский, О. В. Солодухина // Сельскохозяйств. биология. – 2013. – № 2. – С. 31–39.
3. Гончаренко, А. А. Новые направления в селекции озимой ржи на целевое использование / А. А. Гончаренко // Зернобобовые и крупяные культуры. – 2016. – T. 2, № 18. – С. 25–32.
4. Привалов, Ф. И. Достижения и проблемы селекции высокопродуктивных сельскохозяйственных культур в Республике Беларусь / Ф. И. Привалов, Э. П. Урбан // Вес. Нац. акад. навук Беларусi. Сер. aграр. навук. – 2016. – № 3. – С. 41–49.
5. Шлегель, Р. Селекция гибридных форм как стимул развития молекулярно-генетических исследований у ржи / Р. Шлегель // Вавилов. журн. генетики и селекции. – 2015. – Т. 19, № 5. – С. 589–603.
6. Леонова, И. Н. Молекулярные маркеры: использование в селекции зерновых культур для идентификации, интрогрессии и пирамидирования генов / И. Н. Леонова // Вавилов. журн. генетики и селекции. – 2013. – Т. 17, № 2. – С. 314–325.
7. Chikmawati, T. Rye (Secale cereale L.) and wheat (Triticum aestivum L.) simple sequence repeat variation within Secale spp. (Poaceae) / T. Chikmawati, J. Miftahudin, J. P. Gustafson // HAYATI J. Biosci. – 2013. – Vol. 20, N 4. – P. 163–170. https://doi.org/10.4308/hjb.20.4.163
8. Генотипирование сортов мягкой пшеницы разных регионов России / И. Г. Адонина [и др.] // Вавилов. журн. генетики и селекции. – 2016. – Т. 20, № 1. – С. 44–50.
9. Информативные EST-SSR-маркеры для типирования и внутривидовой дифференциации Brassica oleracea var. capitata L. / М. Н. Шаптуренко [и др.] // Вавилов. журн. генетики и селекции. – 2016. – Т. 20, № 1. – С. 51–56.
10. Genetic diversity and phylogenetic relationships in the rye genus Secale L. (rye) based on Secale cereale microsatellite markers / H. I. Shang [et al.] // Genet. Mol. Biol. – 2006. – Vol. 29, N 4. – P. 685–691. https://doi.org/10.1590/S1415-47572006000400018
11. Targońska, M. Assessment of genetic diversity in secale cereale based on ssr markers / M. Targońska, H. BolibokBrągoszewska, M. Rakoczy-Trojanowska // Plant Mol. Biol. Rep. – 2016. – Vol. 34, N 1. – P. 37–51. https://doi.org/10.1007/s11105-015-0896-4
12. Saal, B. Development of simple sequence repeat markers in rye (Secale cereale L.) / B. Saal, G. Wricke // Genome. – 1999. – Vol. 42, N 5. – P. 964–972. https://doi.org/10.1139/g99-052
13. Падутов, В. Е. Методы молекулярно-генетического анализа / В. Е. Падутов, О. Ю. Баранов, Е. В. Воропаев. – Минск : Юнипол, 2007. – 176 с.
14. Чесноков, Ю. В. Оценка меры информационного полиморфизма генетического разнообразия / Ю. В. Чесноков, А. М. Артемьева // Сельскохозяйств. биология. – 2015. – Т. 50, № 5. – С. 571–578.
15. Perrier, X. Darwin software (2006) [Electronic resource] / X. Perrier, J. P. Jacquemoud-Collet. – Mode of access: http://darwin.cirad.fr/darwin. – Date of access: 19.02.2020.